Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4DQ92854 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4DQ92854 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4DQ92854 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms