Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM1Q92611 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM1Q92611 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms