Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113Q902F9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms