Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4AQ8WYN0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms