Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALLDQ8WX93 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms