Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC107Q8WV48 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC107Q8WV48 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms