Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms