Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSKUQ8WUA8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms