Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3RF3Q8TEJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF3Q8TEJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms