Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PIK3C3Q8NEB9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3C3Q8NEB9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms