Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms