Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPC24Q8NBT2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms