Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms