Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38AQ8NAV1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms