Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAAF3Q8N9W5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms