Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DTX3Q8N9I9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DTX3Q8N9I9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DTX3Q8N9I9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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