Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD42Q8N9B4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD42Q8N9B4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms