Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF1Q8N6C5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGSF1Q8N6C5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms