Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS8Q8N3P4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS8Q8N3P4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms