Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.8 ms