Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP2Q8IXW5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms