Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOT2Q8IXI1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms