Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms