Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC50Q8IVM0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms