Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3FQ8IUX4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms