Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NME9Q86XW9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms