Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP1Q86WV1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKAP1Q86WV1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms