Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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