Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CMC1Q7Z7K0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMC1Q7Z7K0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms