Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM15Q7Z3B0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM15Q7Z3B0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms