Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BRINP3Q76B58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRINP3Q76B58 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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