Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms