Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IKBIPQ70UQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IKBIPQ70UQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms