Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC6Q6W4X9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC6Q6W4X9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MUC6Q6W4X9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms