Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCBE1Q6UXH8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms