Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL17Q6UXB2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCL17Q6UXB2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms