Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD1Q6SPF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms