Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms