Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms