Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms