Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZCCHC12Q6PEW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZCCHC12Q6PEW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZCCHC12Q6PEW1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms