Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6P435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6P435 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6P435 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6P435 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q6P435 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6P435 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms