Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms