Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRNP1Q6NT89 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNP1Q6NT89 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms