Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms