Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms