Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4F1Q66K89 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms