Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms