Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf57Q5W0N0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf57Q5W0N0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf57Q5W0N0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf57Q5W0N0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms