Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C9orf84Q5VXU9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
C9orf84Q5VXU9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms